Görüntüleme
6
İndirme
2
Hassas tıp uygulamaları, geleneksel tedaviden farklı olarak kanser hastaları arasındaki bireysel farklılıkları dikkate alarak hastaları sınıflandırır. Yapılan alt tipleme ile kanser teşhisi ve tedavi yanıtının tahmini için yeni biyobelirteçlerin belirlenmesi gerekmektedir. Bu çalışmada, sistem biyolojisi yaklaşımları kullanılarak, rahim ağzı kanserinin en yaygın onkojenik iki türü olan HPV-16 enfekte ve HPV-18 enfekte grupları ayrı ayrı incelenmiştir. Her iki alt-tip için kanserin gelişimi ile ilgili ayırıcı biyobelirteçler sunularak, hassas tıp uygulaması olabilecek alt-tip spesifik teşhis ve tedavi yöntemleri sunma konusunda moleküler hedefler sunulması amaçlanmıştır. Literatürde var olan çalışmalar, hastalık heterojenliği ve alt-tip bilgilerinden bağımsız olarak doğrudan rahim ağzı kanserine odaklanmıştır. İlk defa bu çalışmada HPV-16 ve HPV-18 enfekte hasta grupları ile ilgili transkriptomik veri ayrı ayrı çalışılmıştır. Rahim ağzı kanserinde alt-tip spesifik diyagnostik, prognostik ve ilaç hedefi olabilecek biyobelirteçlerini belirlemek için mikrodizi meta-analizi yapılmıştır. İlk olarak incelenen protein-protein etkileşimlerindeki hub proteinlerde iki alt-tipte de ortak olan 8 protein (AR, AURKA, BRCA1, CDKN2A, EZH2, MYC, PCNA, STAT) dışında, 17’şer protein alt-tiplere spesifik hub proteinler olarak bulunmuştur. Transkripsiyonel düzenlemede önem arz eden TF ve miRNA’lar arasında işaretçi molekül algoritması ile ön plana çıkanlar bulunmuştur. TF’lerde alt-tipleri ayırt edebilecek belirgin farklılık gözlenmemekle birlikte, sadece HIF1α HPV-18 enfekte grubunda işaretçi TF bulunmuştur. HPV-16 spesifik sadece hsa-miR-101-3p ve hsa-let-7d-5p bulunmuştur. HPV-18 enfekte gruba spesifik ise 81 miRNA vardır. Çalışmanın en sonunda ise hub proteinlerin bazılarını hedef alan ilaçlar üzerinden ilaç yeniden konumlandırma yapılmıştır. HPV-16 enfekte kanser tedavisi için ibuprofen ve procainamide ilaçları HPV-18 enfekte kanserler için ise hydralazine ve memantin önerilen ilaçlardandır.
Deficient medical practices classify patients by taking into account individual differences between cancer patients, unlike traditional treatment. It is necessary to identify new biological indicators for the diagnosis of cancer and forecast of the response to treatment. In this study, using system biology approaches, the groups of HPV-16 infected and HPV-18 infected, the two most common oncogenic types of cervical oral cancer, were studied separately. The aim is to provide distinct biological indicators related to the development of cancer for both sub-types, and to provide molecular objectives in providing sub-type specific diagnosis and treatment methods that may be sensitive medical application. The studies in literature, regardless of disease heterogeneity and sub-type information, are directly focused on cervical oral cancer. For the first time in this study, transcriptomic data relating to HPV-16 and HPV-18 infected groups were studied separately. Microdis metaanalysis has been performed in the sub-type cervical cancer to determine the biological indicators that may be specific diagnostic, prognostic and medicinal targets. For the first time studied protein-protein interactions in hub proteins were found as hub proteins specific to the sub-types, in addition to 8 proteins (AR, AURKA, BRCA1, CDKN2A, EZH2, MYC, PCNA, STAT), which are common in two sub-types. TFs and miRNAs that are important in transcription arrangement have been found in the forefront with the indicator molecular algorithm. Although there is no clear difference in TFs that can distinguish sub-types, only in the HIF1α HPV-18 infected group the indicator TF was found. HPV-16 specifics were found only hsa-miR-101-3p and hsa-let-7d-5p. The HPV-18 infected group is specific to 81 miRNAs. At the end of the study, the drug was re-localized through some drugs targeting hub proteins. Ibuprofen and procainamid are medications for the treatment of HPV-16 infected cancers, while hydralazine and memantine are the recommended medications for HPV-18 infected cancers.
Dergi Türü : Uluslararası
Makale Detay 
Benzer Makaleler
PDF Görüntüle
Dergi Bilgisi
Eseri Dinleyin
Alıntı Yap
Bu Sayfayı Yazdırın
Paylaş
Mendeley
