Bazı virüsler hariç tüm canlılarda kalıtımın temel yapısını nükleik asitler oluşturmaktadır. Bilim insanları kalıtım üzerine çeşitli çalışmalar yapmıştır. Yapılan araştırmalar ve deneyler sonucunda bilginin depolanması, bilgiye ulaşma ve bilginin analizinin rahat bir şekilde yapılmasına gerek duyulmuştur. Bunun için biyolojinin bilgisayarlar üzerinde kullanımı 1960’lı yıllarda başlamıştır. Sonrasında bilgisayar bilimleri geliştikçe biyolojinin gelişmesi ve araştırma alanları da artmıştır. Gelişmeler arttıkça biyolojinin büyük çaplı deneyler, makro molekül yapıları, DNA ve RNA gibi alanlarda araştırmaları daha çok olmaya başlamıştır. Son 50 yıl boyunca, hastalıklardaki artış bilim insanlarını DNA dizilimleri üzerinde çalışma yapmaya yönlendirmiştir. 1970’lerin başlarında ilk DNA dizileri üniversite araştırmacıları tarafından bulunmuştur. Daha sonralardan Sanger ve arkadaşları geliştirdikleri dizileme yöntemi ile insan genomunu dizilemeyi başarınca Yeni Nesil Dizileme kavramı ortaya çıkmıştır. Yeni Nesil Dizileme yöntemi kullanılarak çok büyük boyuttaki gen sekanslarına dizileme yapılmıştır. Ancak gen sekanlarının uzunlukları çok büyük olduğu için dizileme yapılırken hatalar ile karşılaşılır. Ayrıca ideal DNA dizileme daha hızlı ve kolay çözüme ulaşmalıdır. Bu çalışmada gen sekanslamadaki hataları azaltma üzerinde çalışılmıştır. Bir filtre yardımı ile büyük boyuttaki gen sekanlarını benzerlik açısına göre birkaç kümeye ayırılmıştır. Ayrılan bu dizilerde doğru sıralamalar elde edilmeye çalışılmıştır.
Nucleic acids form the basic structure of the inheritance in all animals except for some viruses. Scientists have done various studies on heritage. The results of the research and experiments conducted require the storage of information, access to information and the analysis of information to be carried out conveniently. For this purpose, the use of biology on computers began in the 1960s. After that, as computer sciences evolved, the development of biology and the fields of research also increased. As the developments increase, large-scale biological experiments, research in areas such as macro molecular structures, DNA and RNA have begun to increase. Over the past 50 years, the increase in diseases has directed scientists to study on DNA orders. In the early 1970s, the first DNA sequences were found by university researchers. Later, when Sanger et al. succeeded in sequencing the human genome with the sequencing method they developed, the concept of Next Generation Sequencing emerged. Very large gene sequences were sequenced using the Next Generation Sequencing method. However, since the length of the gene sequences is very large, errors are encountered while sequencing. In addition, ideal DNA sequencing should reach a faster and easier solution. In this study, it was studied to reduce errors in gene sequencing. With the help of a filter, large gene sequences were separated into several clusters according to the similarity angle. It has been tried to obtain the correct sequences in these separated sequences.
Alan : Mühendislik
Dergi Türü : Ulusal
Benzer Makaleler | Yazar | # |
---|
Makale | Yazar | # |
---|