Amaç: PPARGC1A geni glikoz-yağ metabolizması ve enerji dengesinde önemli bir role sahiptir. Ayrıca, çiftlik hayvanlarında süt kalitesi ve süt veriminde aday gen olarak kullanabilmektedir. Bu amaçla, Anadolu Mandalarında PPARGC1A geninin 8. eksonundaki polimorfizmler araştırılmıştır. Gereç ve Yöntem: Araştırmada, Afyonkarahisar ilinde yetiştirilen ve Anadolu Mandalarının Halk Elinde Islahı projesi kapsamındaki 183 baş dişi malak incelenmiştir. PPARGC1A gen bölgesinin 8. eksonu ile 9. intronu arasındaki 739 bp büyüklüğündeki bölüm ABI 3500 DNA dizileme cihazı ile araştırılmıştır. İstatistik analizlerde GENETIX paket programı kullanılmıştır. Bulgular: PPARGC1A gen bölgesinin 8. eksonu ile 9. intronu arasındaki 739 bp büyüklüğündeki bölüm çoğaltılmış ve 8. eksonuna ait olan 526 bp lik kısmı değerlendirilmeye alınmıştır. Araştırmada, PPARGC1A geninin 8. eksonunda c.1598 A>T polimorfizmi gözlenmiştir. Yapılan Khi-kare (χ2) analiz sonucunda popülasyonun Hardy- Weinberg dengesinde olmadığı, gözlenen ve beklenen değerler arasındaki fark istatistiki açıdan önemli bulunmuştur (P<0,001). A ve T allelinin frekansı sırasıyla 0,768 ve 0,232 tahmin edilmiştir. İncelenen popülasyonda heterozigotluk %24,59 olarak hesaplanmıştır. Öneri: Sonuç olarak, PPARGC1A geninin 8. eksonundaki c.1598 A>T polimorfizmi amino asit dizilimini etkilemektedir. Dolayısıyla, GAC kodonu Aspartik asiti (Asp), GTC kodonu ise Valin (Val) amino asidini kodladığı için proteinin yapısı ve fonksiyonunun değişebileceği düşünülmektedir. Bu nedenle, c.1598 A>T ve gendeki diğer SNP'lerin büyüme, laktasyonun başlaması ve sürdürülmesi, süt verimi, sütün kalitesi ve sütteki yağ miktarı üzerine etkisinin araştırılarak, sonuçların Anadolu Mandası ıslah çalışmalarında kullanılabileceği düşünülmektedir.
Purpose: PPARGC1A genes play an important role in glucose-fat metabolism and energy balance. It can also be used as a candidate gene for milk quality and milk production in farm animals. For this purpose, polymorphisms in the 8th exon of the PPARGC1A gene have been studied in the Anadolu Mandas. Tools and Methods: The study has studied 183 main female properties grown in the province of Afyonkarahisar and under the framework of the project "Islahııııııııııııııııııııııııııııııııııııııııııııııı. The part of the size of 739 bp between the 8th exon and the 9th intron of the PPARGC1A gen area was studied with the ABI 3500 DNA sorting device. In statistical analysis, the GENETIX package program was used. The findings: the 739 bp-size section between the 8th exon and the 9th intron of the PPARGC1A gen area is multiplied and the 8th. The 526 bp part belonging to the exon was taken to be assessed. In the study, c.1598 A>T polymorphism was observed in the 8th exon of the PPARGC1A gene. The analysis of the Khi-quare (χ2) found the difference between the observed and expected values that the population is not in the Hardy-Weinberg balance is statistically significant (P<0,001). The frequency of allelines A and T is estimated at 0.768 and 0.232 respectively. In the survey population, the heterosigotity is estimated to be 24.59%. Recommendation: As a result, c.1598 A>T polymorphism in the 8th exon of the PPARGC1A gene affects the amino acid sequence. Therefore, it is believed that the GAC code can change the structure and function of the protein because the Aspartic acid (Asp) and the GTC code codes the Valin (Val) amino acid. That is why c. 1598 A>T and other SNPs in the gene, by researching their effects on growth, the beginning and continuation of lactation, dairy production, the quality of milk and the amount of fat in milk, the results are believed to be used in the Anatolian Mandas healing studies.
Alan : Sağlık Bilimleri
Dergi Türü : Uluslararası
Benzer Makaleler | Yazar | # |
---|
Makale | Yazar | # |
---|